Rabu, 15 Januari 2014

Recommended software kimia lain

ChemSW ChemSite Standart Demo 

ChemSW ChemSite Standart Demo adalah software yang digunakan untuk mengambarkan struktur molekul 3D dari senyawa karbon, Gula, Asam Amino, dan Asam nukleat.

Garlic 
Merupakan program untuk menampilkan struktur protein dari file pdb 2.1. program ini diperuntukkan untuk investigasi dan mengedit semua protein dan molekul. Garlic dimasukkan ke dalam repository beberapa distro seperti Debian, Suse, Mandriva, Linspire dll.


Software Kimia – Jmol

Software Kimia – Jmol
Jmol
Jmol merupakan 3D viewer for chemical structures yang berbasis java. Aplikasi ini gratis. Selain gratis aplikasi ini kompetabel dengan os windows, mac OS X dan linux/unix. Aplikasi ini bisa di download disitus resminya -> http://jmol.sourceforge.net/download/. Untuk aplikasi jmol ini tidak membutuhkan persyaratan komputer yang neko-neko, yang penting komputer yang digunakan suport dengan java 1.4 keatas. Tutorial instalasi untuk masing-masing sistem operasinya bisa di lihat disitusnya.
Setelah diinstal di komputer, saatnya menggunakan aplikasi ini. Penggunaan utama aplikisi ini kan untuk melihat suatu senyawa secara tiga dimensi tetapi selain itu kita juga bisa menggambar dengan menggunakan jmol ini. Untuk melihat suatu senyawa, data base nya bisa di download di PupChem. Senyawa yang kita butuhkan bisa di peroleh dengan mudah dan gratis. Di PupChem tersebut hanya tinggal ketik nama senyawa dan di download file dengan tipe .sdf yang 3D-nya ya.
Gambar di bawah ini adalah contohnya:



Jmol yang digunakan dalam sistem operasi linux (PCLinuxOS). Kalau untuk menggambar senyawa sesuai dengan keinginan yang pertama kali ada lah membuka jmol dengan tampilan polos.

Lalu pada menu tool bar nya klik pada gambar ikon “Open the model kit“

Setelah di klik muncul seperti ini deh.

Nah langsung muncul senyawa CH4. Untuk merubah senyawa ini dapat klik kanan di sembarang tempat di layar yang berwarna hitam lalu pilih ikon yang bergambar senyawa dan pilih jenis senyawanya. Digambar saya memilih senyawa CH3NO2

Nah jadi deh senyawa CH3NO2-nya. Software ini sangat berguna jika kita mempelajari tentang suatu senyawa atau kita juga dapat menggukanan aplikasi ini untuk proses belajar mengajar.
Untuk menu didalam sebenarnya masih banyak dan Jmol dapat menggunakan suatu script. Untuk keperluan yang sederhana seperti diatas, kemampuan mengolah data sebatas menggambar itu sudah cukup untuk mengoperasikan aplikasi ini. Untuk hal yang lebih rumit kemampuan dalam bahasa pemrograman juga di butuhkan.
Selamat mencoba ya,,, Yang sudah bisa kudu di bagi-bagi ilmunya,,,
Sumber :


Struktur molekul kompleks dengan ArgusLab

Desain struktur molekul kompleks dengan ArgusLab



Program ini memungkinkan Anda untuk menggambar konfigurasi protein yang sangat kompleks, memperoleh rantai heliks asam amino dan lain-lain. ArgusLab menggunakan sistem pohon untuk mengatur semua elemen untuk menambah struktur apapun untuk kemudian menampilkan data ini sebagai gambar, sehingga memungkinkan Anda untuk menganalisisnya secara visual. Jika Anda tidak fasih dalam ilmu molekuler maka Anda tidak akan belajar terlalu banyak dari tool ini tetapi jika sebaliknya maka ArgusLab merupakan perangkat gratis yang luar biasa untuk penelitian Anda.



source : www.arguslab.com


Kimux 1.01 hydrogen

SOFTWARE UNTUK KIMIA

Kimux 1.01 hydrogen adalah rilis perdana paket aplikasi kimia linux yang merupakan remastering distro Ubuntu 11.04. Kimux ini dibuat untuk membantu para pengguna pemula linux yang tidak ingin direpotkan dengan instalasi linux dan aplikasi kimia yang begitu banyak. Hanya dengan instalasi Kimux maka akan diperoleh paket linux beserta aplikasi kimia yang tinggal pakai.
Pengembangan sekarang ini sudah sampai edisi Kimux 1.02 hydrogen yang merupakan perbaikan dan penambahan aplikasi dari edisi sebelumnya.
Bulan Agustus 2012 rilis edisi baru yaitu Kimux BlankOn Rote, berisi lebih dari 30 software kimia yang berasal dari repository BlankOn Rote 8.0. Pada perkembangan selanjutnya akan ditambahkan software kimia yang berasal dari luar repository Debian/Ubuntu/BlankOn tetapi tetap 'free and open source software (FOSS).
1. Pada Ubuntu di option System Tools, pilih Ubuntu Software Centre atau Synaptic Package Manager. lalu pilih aplikasi yang Anda inginkan.
2.  Pada Synaptic Package Manager pilih aplikasi yang belum terpasang pada PC Anda yang ditandai dengan icon aplikasi berwarna putih. Klik icon tersebut lalu klik Apply. Tunggu hingga semua proses pemasangan selesai.
3.  Command Line Interface (CLI) http://repo.unnes.ac.id/dokumen. Lalu search aplikasi yang Anda inginkan
4. Pada Ubuntu, di option Utilities klik "Terminal". Pada terminal ketik sudo apt-get install (diikuti nama aplikasi yang Anda ingin pasang), contoh sudo apt-get install avogadro. Lalu masukkan password sesuai password Ubuntu Anda. Klik enter sampai semua terpasang.
NB : saat pemasangan aplikasi harus terhubung dengan koneksi internet

1. Pilih system tools, klik administration
2. pilih remastersys
3. setelah muncul kotak dialog pilih customize untuk mengubah tampilan Ubuntu Anda, kemudian select
4. pada configure file dalam customize pilih Kimux 13.10 Live pada LIVECDLABEL pada CUSTOMISO ketik kimux 13.10 iso
5. pilih save
6. pilih main
7. pilih backup
8. tunggu hingga semua proses remastersys selesai, kemudian pilih OK. maka remastersys beserta ISO telah selesai



Software Kimia - Chem Draw

Software Kimia - Chem Draw
Chem Office merupakan salah satu software yang digunakan untuk membuat struktur kimia dengan mudah. Sofware ini banyak memilki kelebihan untuk mempermudah kita menggambar rumus kimia. Untukmenggambar rumus molekul kimia Chem Office menyertakan Chem Draw dan Chem 3D.

Chemdraw merupakan software kimia dari produk Cabridgesoft.inc. ChemDraw memiliki banyak fungsi, diantaranya membuat nama dan struktur senyawa, membuat struktur streokimia dengan benar dari nama kimia, menghitung rumus molekul dan berat molekul, dan mendapatkan nama IUPAC dengan akurat dari struktur. Perkiraan spektra NMR dari struktur suatu senyawa dengan atom langsung dengan korelasi spektral. Selain itu, ChemDraw dilengkapi dengan peringatan jika terjadi kesalahan dalam pembuatan struktur kimia. Peringatan tersebut biasanya berwarna merah dan mengelilingi bagian struktur yang salah.

Langkah-langkah penggunaannya adalah sebagai berikut :
1. Tulis nama suatu senyawa pada lembar ChemDraw
2. Pilih structure pada bagian toolbar
3. Pilih name convert to structure
Namun nama senyawa tersebut harus sesuai (IUPAC)

Sedangkan Chem3D dapat digunakan untuk menggambar struktur molekul dalam bentuk 3 Dimensi (3D), menghitung energi minimum, panjang ikatan antar atom.
Struktur-struktur tertentu yang telah umum dapat digambar secara langsung dengan mengklik tool, seperti struktur cincin benzena, siklopentana, sikloheksana dan senyawa siklis yang lain. Tool dalam ChemDraw juga menyajikan gambar struktur untuk asam amino, DNA, dan RNA yang terdapat dalam template, anda tinggal klik, membawanya ke layar, drag, maka jadilah gambar struktur anda.




Source :
http://www.artikelkimia.info/membuat-rumus-kimia-dengan-chem-office-28481629082011
http://raschemistry.wordpress.com/tag/chemdraw/
elib.pdii.lipi.go.id/katalog/index.php/searchkatalog/.../6363.pdf


CARA MENGGUNAKAN CHEMTOOL

CARA MENGGUNAKAN APLIKASI CHEMTOOL
Chemtool adalah program untuk menggambar struktur terutama senyawa organik. Chemtool mudah digunakan untuk menggambar selain terdapat tools untuk menghitung massa molekular. Instalasi chemtool sangat mudah karena beberapa distro besar memasukkan chemtool ke dalam repository mereka. Bahkan instalasi dari source codenya pun juga mudah. Nah sekarang ayo kita belajar cara menggunakan aplikasi chemtool. Pertama ketika Anda membuka aplikasi chemtool maka muncul tampilan seperti di bawah ini:



Untuk memulainya klik menu tools-tempaltes maka akan muncul tampilan sepserti dibawah ini. Tampilan templates-carboncycles. Pilih struktur yang Anda hendaki.

Untuk templates sugars maka muncul pilihan di bawah ini. Pilih struktur yang Anda inginkan


Untuk templates heterocycles maka muncul pilihan di bawah ini. Pilih struktur yang Anda inginkan.

Untuk templates amino acids maka muncul pilihan di bawah ini. Pilih struktur yang Anda inginkan.




Untuk templates symbols maka muncul pilihan di bawah ini. Pilih struktur yang Anda inginkan.




Cara memilihnya mudah sekali, misal saya menginginkan struktur glukosa, maka hanya mengeklik strultur glucose yang ada di tempaltes sugars. Dan hasilnya adalah:








Selain struktur yang sudah disediakan tadi. Anda juga bisa mengambar sendiri strukur yang Anda kehendaki. Semisal ingin membuat sikloheksana, maka caranya adalah klik





Kemudian untuk memberi namanya adalah klik







RENCANA PELAKSANAAN PEMBELAJARAN MAKROMOLEKUL

RENCANA PELAKSANAAN PEMBELAJARAN ( RPP )

Nama Sekolah                         : SMA N 1 PEMALANG
Mata Pelajaran                        : Kimia
Kelas / Semester                      : XII / 5
Pertemuan ke                         : 10
Alokasi Waktu                        : 2 x 45”
Standar Kompetensi               : Menjelaskan Sistem Klasifikasi dan Kegunaan Makromolekul
Kompetensi Dasar                   : Menjelaskan Karbohidrat, Klasifikasi dan Penggunaannya

Indikator
1.        Karbohidrat dan klasifikasinya dideskripsikan dengan jelas
2.        Penggunaan karbohidrat dalam kehidupan dideskripsikan dengan benar

I.     TUJUAN PEMBELAJARAN
Setelah mempelajari uraian materi kegiatan belajar ini, siswa dapat :
1.        Mendeskripsikan karbohidrat dan klasifikasinya dengan jelas
2.        Mendeskripsikan penggunaan karbohidrat dalam kehidupan dengan benar

II.     MATERI PEMBELAJARAN
1.        Karbohidrat dan klasifikasinya
2.        Aplikasi karbohidrat

III.     PENDEKATAN DAN METODE
1.        Pendekatan     : Pendekatan Proses
2.        Metode           : Diskusi Informasi dan Tanya Jawab

IV.     LANGKAH-LANGKAH KEGIATAN PEMBELAJARAN
Kegiatan
Uraian
waktu
Kegiatan awal
Pendahuluan
1.    Berdoa dan presensi siswa
2.    Guru menjelaskan indikator dan tujuan pembelajaran yang harus dicapai siswa melalui pembelajaran hari ini
3.    Prasyarat pengetahuan : definisi karbohidrat
4.    Motivasi : makanan yang kita makan harus mengandung karbohidrat untuk sumber energi
5.    Masalah : menanyakan pada siswa tentang  makanan-makanan yang mengandung karbohidrat
10”
Kegiatan inti
Eksplorasi
1.      Diskusi dan informasi tentang macam-macam karbohidrat
2.      Diskusi dan informasi tentang kegunaan karbohidrat

Elaborasi
Mengerjakan soal-soal latihan karbohidrat
Konfirmasi
Menyamakan persepsi tentang karbohidrat
70”
Kegiatan akhir
Penutup
Memberikan soal-soal latihan dan pekerjaan rumah serta memberi tugas membaca untuk pertemuan berikutnya tentang lipid
10”

V.     ALAT DAN  SUMBER BELAJAR
Buku teks atau buku paket kimia SMK/SMA Kelas XI

                       

















RENCANA PELAKSANAAN PEMBELAJARAN ( RPP )

Nama Sekolah                         : SMA N 1 PEMALANG
Mata Pelajaran                        : Kimia
Kelas / Semester                      : XII / 5
Pertemuan ke                         : 11
Alokasi Waktu                        : 2 x 45”
Standar Kompetensi               : Menjelaskan Sistem Klasifikasi dan Kegunaan Makromolekul
Kompetensi Dasar                   : Menjelaskan Lipid, Klasifikasi dan penggunaannya

Indikator
1.      Lipid dan klasifikasinya dideskripsikan dengan jelas
2.      Penggunaan lipid dalam kehidupan dideskripsikan dengan jelas

I.         TUJUAN PEMBELAJARAN
Setelah mempelajari uraian materi kegiatan belajar ini, siswa dapat :
1.        Mendeskripsikan lipid dan klasifikasinya dengan jelas
2.        Mendeskripsikan penggunaan lipid dalam kehidupan dengan jelas

II.      MATERI PEMBELAJARAN
1.      Lipid dan klasifikasinya
2.      Aplikasi lipid

III.   PENDEKATAN DAN METODE
1.        Pendekatan     : Pendekatan Proses
2.        Metode           : Diskusi Informasi dan Tanya Jawab

IV.   LANGKAH-LANGKAH KEGIATAN PEMBELAJARAN
Kegiatan
Uraian
Waktu
Kegiatan awal
Pendahuluan
1.    Berdoa dan presensi siswa
2.    Guru menjelaskan indikator dan tujuan pembelajaran yang harus dicapai siswa melalui pembelajaran hari ini
3.    Mengingatkan pembelajaran minggu lalu tentang karbohidrat
4.    Prasyarat pengetahuan : pengertian lipid
5.    Motivasi : makanan yang kita makan harus mengandung lipid untuk sumber energi cadangan bagi tubuh
6.    Masalah : menanyakan pada siswa tentang  makanan-makanan yang mengandung lipid
10”
Kegiatan inti
Eksplorasi
1.      Diskusi dan informasi tentang macam-macam lipid
2.      Diskusi dan informasi tentang kegunaan lipid
Elaborasi
Mengerjakan soal-soal latihan lipid
Konfirmasi
Menyamakan persepsi tentang lipid
70”
Kegiatan akhir
Penutup
Memberikan soal-soal latihan dan pekerjaan rumah serta memberi tugas membaca untuk pertemuan berikutnya tentang protein
 10”

V.      ALAT DAN SUMBER BELAJAR
Buku teks atau buku paket kimia SMK/SMA Kelas XI
                       























RENCANA PELAKSANAAN PEMBELAJARAN ( RPP )

Nama Sekolah                         : SMA N 1 PEMALANG
Mata Pelajaran                        : Kimia
Kelas / Semester                      : XII / 5
Pertemuan ke                          : 12
Alokasi Waktu                        : 2 x 45”
Standar Kompetensi               : Menjelaskan Sistem Klasifikasi dan Kegunaan Makromolekul
Kompetensi Dasar                   : Menjelaskan Protein, Klasifikasi dan penggunaannya

Indikator
1.      Protein dan klasifikasinya dideskripsikan dengan jelas
2.      Penggunaan protein dalam kehidupan dideskripsikan dengan jelas

I.              TUJUAN PEMBELAJARAN
Setelah mempelajari uraian materi kegiatan belajar ini, siswa dapat :
1.         Mendeskripsikan protein dan klasifikasinya dengan jelas
2.         Mendeskripsikan penggunaan protein dalam kehidupan dengan jelas

II.           MATERI PEMBELAJARAN
1.         Protein dan klasifikasinya
2.         Aplikasi protein

III.        PENDEKATAN DAN METODE
1.         Pendekatan               : Pendekatan Proses
2.         Metode                     : Diskusi Informasi dan Tanya Jawab

IV.        LANGKAH-LANGKAH KEGIATAN PEMBELAJARAN
Kegiatan
Uraian
waktu
Kegiatan awal
Pendahuluan
1.    Berdoa dan presensi siswa
2.    Guru menjelaskan indikator dan tujuan pembelajaran yang harus dicapai siswa melalui pembelajaran hari ini
3.    Mengingatkan pembelajaran minggu lalu tentang lipid
4.    Prasyarat pengetahuan : pengertian protein
5.    Motivasi : makanan yang kita makan harus mengandung protein untuk zat pembangun, dan pengatur tubuh
6.    Masalah : menanyakan pada siswa tentang  makanan-makanan yang mengandung protein
10”
Kegiatan inti
Eksplorasi
1.      Diskusi dan informasi tentang macam-macam protein
2.      Diskusi dan informasi tentang kegunaan protein
Elaborasi
Mengerjakan soal-soal latihan protein
Konfirmasi
Menyamakan persepsi tentang protein
70”
Kegiatan akhir
Penutup
Memberikan soal-soal latihan dan pekerjaan rumah serta memberi tugas membaca untuk pertemuan berikutnya tentang polimer
 10”


V.           ALAT DAN  SUMBER BELAJAR

Buku teks atau buku paket kimia SMK/SMA Kelas XI